Nitraten zijn niet schadelijk voor de gezondheid. In ons spijsverteringsstelsel worden ze omgezet tot nitriet, wat wel schadelijk is. Hoe schadelijk hangt af van de hoeveelheid die je binnenkrijgt. De Wereldgezondheidsorganisatie legde een norm van 50 mg nitraat per liter vast. Deze norm wordt door alle drinkwatermaatschappijen gerespecteerd.
Bij zuigelingen is de kans groter dat nitraat wordt omgezet naar nitriet en zij drinken bij voorkeur flessenwater.